Как я могу изменить внешний вид DoxyWizard, чтобы все было больше ?: большие элементы меню, больший текст в текстовом окне и т. Д.
На данный момент нет условий для этого. Единственная возможность - получить исходный код, найти подходящие места, изменить его и собрать.
Не стесняйтесь отправить вопрос в трекер проблем с кислородом: https://github.com/doxygen/doxygen/issues/new