Я ищу решение, которое не позволяет некоторым пользователям просматривать историю коммитов для репозитория.
Кроме удаления старых коммитов, есть ли способ сохранить коммиты, но скрыть их или заблокировать?
Вы можете заблокировать пользователя, как описано на странице https://help.github.com/articles/blocking-a-user-from-your-personal-account/