Сначала посмотрите ваше CREATE TABLE
утверждение:
SHOW CREATE TABLE tablename
Он покажет вам все ваши полнотекстовые индексы, как это:
…,
FULLTEXT KEY key_name (column_list),
…
Отбросьте все эти ключи:
ALTER TABLE tablename DROP INDEX key_name;
…
, затем конвертировать:
ALTER TABLE tablename ENGINE=InnoDB;