Каким-то образом вы обновились с 6.2.4 до 6.5.0, но забыли обновить плагины.
Чтобы решить эту проблему, просто выполните следующие две команды:
$ sudo bin/elasticsearch-plugin remove ingest-geoip
$ sudo bin/elasticsearch-plugin install ingest-geoip
ОБНОВЛЕНИЕ : Стоит отметить, что начиная с ES 6.7 ingest-geoip
будет полнофункциональным модулем ES и больше не будет нуждаться в установке в качестве плагина.