Выводы были разные в терминале windows и txt файле? - PullRequest
Новая
       41

Выводы были разные в терминале windows и txt файле?

0 голосов
/ 16 ноября 2018

Я пытаюсь объединить два файла с помощью Perl.

Коды на данный момент: 

 my $hash_ref;  
 open (my $I_fh, "<", "File1.txt") or die $!;

 my $line = <$I_fh>;
 while ($line = <$I_fh>) {
 chomp $line;
 my @cols = split ("\t", $line);
 my $key = $cols[1];
 $hash_ref -> {$key} = \@cols;
 }
 close $I_fh;

 open (my $O_fh, "<", "File2.txt") or die $!;
 while ($line = <$O_fh>) {
 chomp $line;
 my @cols = split ("\t", $line);
 my $key = shift (@cols);
 push (@{$hash_ref -> {$key}}, @cols);

 }
 close $O_fh;


 open (my $out, ">", "merged.txt") or die $!;

 foreach my $key (sort keys %$hash_ref) {

 my $row = join ("\t", @{$hash_ref -> {$key}});

print $out "$key\t$row\n";
 }
close $out;

Я использую функцию печати или Dumper для проверки каждого шага. В терминальных окнах все нормально. Однако в моем выходном файле (объединенный TXT) формат был изменен. Я хотел бы объединить два файла, добавив больше столбцов, но не добавляя больше строк. Как я могу исправить коды? 

  File 1.txt:  
  Index    Name    Column1   Column2  
   1        A1                  AB      
   2        A2                  CD   
   3        B1                  EF    
   4        B2                  GH   


    File 2.txt:   
    Name  Type  
     A1     1  
     A2     1   
     B1     2   
     B2     1    

   Merged file:  

   A1   1   AB    
        1     
   A2   2   CD  
        1      
   B1   3   EF  
        2      
   B2   4   GH   
        1      

Wanted file:  
Name  Type  Column2  

  A1   1   AB    
  A2   1   CD   
  B1   2   EF   
  B2   1   GH

1 Ответ

0 голосов
/ 16 ноября 2018

Предполагая, что файлы отсортированы по столбцу имени, это действительно легко сделать благодаря программе join (1) : 

$ join --header -t $'\t' -o 2.1,2.2,1.4 -1 2 -2 1 file1.tsv file2.tsv
Name    Type    Column2
A1  1   AB
A2  1   CD
B1  2   EF
B2  1   GH

Параметр --header представляет собой расширение GNU, которое исключает объединение первых строк двух файлов и рассматривает их как заголовки столбцов. -t устанавливает разделитель столбцов, -o контролирует, какие столбцы включаются в вывод (список спецификаторов FILE.COLUMN), а -1 и -2 выбирают столбцы, которые используются для объединения двух файлов.

Если они не отсортированы или если вы настроены на Perl, ваш код выглядит очень-очень близко; Помимо всех опечаток и тому подобного, вы распечатываете все столбцы, а не только те, которые вы хотите получить. Рассмотрим: 

#!/usr/bin/perl
use warnings;
use strict;
use feature qw/say/;
use autodie;

my %names;

sub read_file {
  my ($file, $idx) = @_;
  open my $in, "<", $file;
  my $header = <$in>;
  while (<$in>) {
    chomp;
    my @F = split /\t/;
    push @{$names{$F[$idx]}}, \@F;
  }
}

read_file "file1.tsv", 1;
read_file "file2.tsv", 0;

say "Name\tType\tColumn2";
for my $n (sort keys %names) {
  my $row = $names{$n};
  say "$n\t$row->[1][1]\t$row->[0][3]";
}

Я также подозреваю, что ваш странный вывод может быть объяснен запуском вашей программы на файлах данных, использующих окончания строк в стиле Windows, когда ваша ОС использует окончания строк в стиле Unix.

...