Мне нужно прочитать файл GWAS с именем nnnnn.gwas.imputed_v3.both_sexes.tsv.bgz Как я могу прочитать это в R или преобразовать его во что-то, что R может читать?
Tried
aa_100022 <- read_tsv (100022.gwas.imputed_v3.both_sexes.tsv.bgz) </p>
и получил это сообщение:
Ошибка: неожиданный символ в «aa_100022 <- read_tsv (100022.gwas.imputed_v3.both_sexes.tsv.bgz "</p>
В документе для read_delim сказано, что файлы, заканчивающиеся на .gz, .bz2, .xz или .zip, будут автоматически распакованы. Никаких упоминаний о .bgz также не работаетэтот файл: read.tsv, read_csv, read.csv - то же сообщение
Итак, я вернулся к вопросу о том, как мне распаковать .bgz? Это можно сделать в R, или файл требует предварительной обработкипрежде чем я доберусь до R? Это вопрос SuperUser?