Убедитесь, что Runtime Server правильно добавлен в IntelliJ. После правильного добавления вы увидите вкладку Серверы приложений , на которой вы сможете эффективно добавлять / удалять приложения.
Состояние развертывания можно увидеть как Модуль с отметкой на вкладке Серверы приложений.