Документация содержит пример, в котором вы указываете PAC-скрипт :
var config = {
mode: "pac_script",
pacScript: {
data: "function FindProxyForURL(url, host) {\n" +
" if (host == 'foobar.com')\n" +
" return 'PROXY blackhole:80';\n" +
" return 'DIRECT';\n" +
"}"
}
};
chrome.proxy.settings.set(
{value: config, scope: 'regular'},
function() {});
Пример делает именно то, что вам нужно для 1 домена, и его можно расширить на несколько доменов.