Вы можете группировать по полям, которые должны быть уникальными, а затем выбирать строки, в которых количество равно единице.
SELECT *
FROM
mytable
INNER JOIN (
SELECT id
FROM
mytable
GROUP BY
col1, col2, col3
HAVING
COUNT(*) = 1
) t
ON mytable.id = t.id;
Существует несколько решений.В зависимости от объема данных и требований к производительности вы можете добавить индексы и протестировать несколько решений для получения оптимальных результатов.