Как связать библиотеку Cublas с CMake CUDA 10.0 Ubuntu 18 - PullRequest
Новая
       99

Как связать библиотеку Cublas с CMake CUDA 10.0 Ubuntu 18

0 голосов
/ 24 января 2019

Следующий код относится к моему файлу CMakeList, и он может хорошо работать на CUDA 9.2 Ubuntu 14. Однако, когда я пытаюсь запустить его на нашем новом сервере, я получаю сообщение об ошибке. 

set(CMAKE_CXX_FLAGS "${CMAKE_CXX_FLAGS} -O2 -std=c++11")
SET(CMAKE_C_FLAGS "${CMAKE_C_FLAGS} -O2")
cmake_minimum_required(VERSION 3.0)

project(LMM)
set(DYLD_LIBRARY_PATH /usr/local/include)
find_package(GSL REQUIRED)
find_package(BLAS REQUIRED)
find_package(CUDA)
if (CUDA_FOUND)
    message("CUDA found")
else()
    message("CUDA not found, doing something alternatively")
endif()

include_directories(test_cuda PRIVARE
                    ${GSL_INCLUDE_DIRS}
                    ${BLAS_INCLUDE_DIRS}
                    ${CUDA_INCLUDE_DIRS}
                    ${CUDA_CUBLAS_DIRS}
                    ${PROJECT_SOURCE_DIR})

add_executable(GPU_LMM main.cpp aux.cpp)
target_link_libraries( GPU_LMM  PRIVATE
                        ${GSL_LIBRARY}
                        ${BLAS_LIBRARIES}
                        ${CUDA_LIBRARIES})

Информация журнала выглядит следующим образом. 

-- The C compiler identification is GNU 7.3.0
-- The CXX compiler identification is GNU 7.3.0
-- Check for working C compiler: /usr/bin/cc
-- Check for working C compiler: /usr/bin/cc -- works
-- Detecting C compiler ABI info
-- Detecting C compiler ABI info - done
-- Detecting C compile features
-- Detecting C compile features - done
-- Check for working CXX compiler: /usr/bin/c++
-- Check for working CXX compiler: /usr/bin/c++ -- works
-- Detecting CXX compiler ABI info
-- Detecting CXX compiler ABI info - done
-- Detecting CXX compile features
-- Detecting CXX compile features - done
-- Found PkgConfig: /usr/bin/pkg-config (found version "0.29.1") 
-- Found GSL: /usr/include (found version "2.4") 
-- Looking for sgemm_
-- Looking for sgemm_ - found
-- Looking for pthread.h
-- Looking for pthread.h - found
-- Looking for pthread_create
-- Looking for pthread_create - not found
-- Looking for pthread_create in pthreads
-- Looking for pthread_create in pthreads - not found
-- Looking for pthread_create in pthread
-- Looking for pthread_create in pthread - found
-- Found Threads: TRUE  
-- A library with BLAS API found.
-- Found CUDA: /usr/local/cuda (found version "10.0") 
CUDA found
-- Configuring done
-- Generating done

Однако, когда я запускаю свою программу, я получаю следующее сообщение об ошибке. 

aux.cpp:(.text+0x28d1): undefined reference to `cublasSetVector'
aux.cpp:(.text+0x290e): undefined reference to `cublasSetMatrix'
aux.cpp:(.text+0x2942): undefined reference to `cublasSetMatrix'
aux.cpp:(.text+0x2994): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x29e0): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2a32): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2a6c): undefined reference to `cublasSaxpy_v2'
aux.cpp:(.text+0x2b4a): undefined reference to `cublasSetMatrix'
aux.cpp:(.text+0x2bed): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2c3c): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2c7c): undefined reference to `cublasScopy_v2'
aux.cpp:(.text+0x2cb4): undefined reference to `cublasSaxpy_v2'
aux.cpp:(.text+0x2d1e): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2d6a): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2dbc): undefined reference to `cublasSgemv_v2'
aux.cpp:(.text+0x2df6): undefined reference to `cublasSaxpy_v2'
aux.cpp:(.text+0x2e25): undefined reference to `cublasGetVector'
aux.cpp:(.text+0x2e50): undefined reference to `cublasGetVector'

Я удостоверяюсь, что я установил Cublas на сервер, потому что я могу воспроизвести официальную демонстрацию Cublas. Когда я добавляю CUDA_CUBLAS_LIBRARIES, я получаю следующую ошибку. 

-- A library with BLAS API found.
CUDA found
CMake Error: The following variables are used in this project, but they are set to NOTFOUND.
Please set them or make sure they are set and tested correctly in the CMake files:
CUDA_cublas_device_LIBRARY (ADVANCED)
    linked by target "GPU_LMM" in directory /home/szhangcj/C++/LMM

-- Configuring incomplete, errors occurred!

1 Ответ

0 голосов
/ 24 января 2019

Script FindCUDA.cmake для последних версий CMake (например, 13.0) знает, что библиотека cublas_device больше не используется со времен CUDA 9.2, и сценарий не ищет эту библиотеку.

Поскольку ваше сообщение об ошибке отмечает cublas_device библиотеку, это означает, что ваш FindCUDA.cmake скрипт слишком стар и не может работать с новейшими версиями CUDA.

Для правильного использования find_package(CUDA) с последней версией CUDA, вам нужно обновить CMake.

...