Вариант А:
Перейдите в основной класс> щелкните правой кнопкой мыши> отладка как Java-приложение
Вариант B:
Используйте следующую команду, и из eclipse настройте удаленную отладку для своего проекта на порту 5870
mvn spring-boot:run -Drun.jvmArguments="-Xdebug -Xrunjdwp:transport=dt_socket,server=y,suspend=y,address=5870"