У вас есть несколько вариантов.
1) Переустанавливайте все при каждом запуске Cloud Shell.Это звучит плохо, но если вы храните свои файлы в GCS, копирование происходит очень быстро.
2) Cloud Shell - это контейнер Docker.Вы можете изменить этот контейнер так, чтобы вы запускали Cloud Shell, используя свой настроенный контейнер.Запустите Cloud Shell.В строке заголовка справа находится значок, похожий на ноутбук.Нажмите на это.Откроется окно с подробной информацией о настройке контейнера Docker.
3) Храните все локально в своем домашнем каталоге.Дерево домашней директории является постоянным и будет восстанавливаться каждый раз при воссоздании виртуальной машины Cloud Shell.