Нашел решение для этой проблемы.Исправление было необходимо при создании объекта ICsvListWriter.Ранее у меня был этот код, где «response» - это HttpServletResponse.
CsvPreference preference = new CsvPreference.Builder(CsvPreference.STANDARD_PREFERENCE).useEncoder(new DefaultCsvEncoder()).build();
ICsvListWriter csvWriter = new CsvListWriter(response.getWriter(), preference);
Этот код расширен до этого:
ServletOutputStream output = response.getOutputStream();
output.write(new byte[] { (byte)0xEF, (byte)0xBB, (byte)0xBF });
PrintWriter writer = new PrintWriter(new OutputStreamWriter(output, "UTF-8"));
CsvPreference preference = new CsvPreference.Builder(CsvPreference.STANDARD_PREFERENCE).useEncoder(new DefaultCsvEncoder()).build();
ICsvListWriter csvWriter = new CsvListWriter(writer, preference);
Это исправило проблему, и теперь все символы верхнего индекса теперьпоступает правильно в сгенерированный файл CSV без каких-либо ненужных символовНезависимо от того, использую ли я настоящие символы верхнего индекса или их Unicode, это исправление работает.