У меня есть 3 неизвестных генома, и у меня есть 15 геномов (5 для бактерий, 5 для грибка, 5 для дрожжей).Я нашел двойные комбинации всех этих геномов.Двойные комбинации: AA, AT, AG, AC, ... (16 комбинаций).Затем я нашел их процент в геноме.Наконец, я получил 3 контрольных средних процентных значения от бактерий, грибков и дрожжей, и я хочу сравнить эти процентные значения с 3 неизвестными процентами генома.Кстати, я могу определить, какой геном принадлежит какой семье.Что мне делать, есть ли какой-нибудь пакет для их выполнения?
Например, у меня test1percentages следующим образом:
>0.09583437 -- 0.05393204 -- 0.06488782 -- 0.07903921 -- 0.06890654 -- 0.04395304 -- 0.02788807
0.06502646 -- 0.06932366 -- 0.03773925 -- 0.04409289 -- 0.05457230 -- 0.05962886 -- 0.07014978
0.06885963 -- 0.09616608
И у меня процент бактерий, грибов, дрожжей как;
>allbacs
0.05421850 -- 0.05540724 -- 0.05065422 -- 0.05524792 -- 0.06539913 --
0.07254104 -- 0.09583958
0.05023776 -- 0.05921741 -- 0.09700061 -- 0.07263406 -- 0.05576768 --
0.03669278 -- 0.05906868 --
0.06549191 -- 0.05458147
>allyeasts
0.08239379 -- 0.05602528 -- 0.05407910 -- 0.07096754 -- 0.05685478 -- 0.05165226 -- 0.04809652
0.06476042 -- 0.06680492 -- 0.04832589 -- 0.04111317 -- 0.05642334 --
0.05840699 -- 0.06536005 --
0.06937911 -- 0.10935685
>allfungus
0.08458809 -- 0.05068602 -- 0.07291263 -- 0.07811563 -- 0.04697502 --
0.05680199 -- 0.04689305
0.06906349 -- 0.05600454 -- 0.05504048 -- 0.04973311 -- 0.05383871 --
0.09893712 -- 0.05720541
0.04476084 -- 0.07844389
(Test1 принадлежит грибку)
Как я могу сравнить их сходство?Я пытался построить и прокомментировать их, но профессор сказал, что это должно быть автоматическим.
Спасибо