Для всех, кто находился в той же ситуации, следующие работали для меня
MyShema.post('findOneAndUpdate', function(doc) {
doc.set("new_field", 2, {strict: false});
doc.set({set: true})
});
Строгий режим - это истина, который не позволяет добавить новый ключ-val, который мы должны отключить, чтобы добавить ключ