К сожалению, вы не можете, чтобы ваша память Java находилась в памяти вашего сервера, тогда как ваши переменные javascript являются частью памяти браузера пользователя, то есть системы пользователя. Таким образом, у вас не может быть общей памяти, но вы определенно можете установить связь между вашим сервером и клиентом через http.
Так что, если вам нужно сохранить некоторые переменные javascript на вашем сервере, вы можете инициировать ajax-запрос от клиента, который передаст данные на сервер. Получив его, вы можете делать с ним все, что захотите