Нет способа сделать это без изменения кода.
Существует аннотация, которая может использоваться на процессоре для того, чтобы указать опции планирования по умолчанию:
@DefaultSchedule(strategy = SchedulingStrategy.TIMER_DRIVEN, period = "1 min")
Вам потребуется получить исходный код NiFi и добавить эту аннотацию в GenerateFlowFile, а затем перестроить стандартный NAR и развернуть его в своем экземпляре NiFi.