Always Encrypted работает на уровне столбца, а не базы данных или таблицы. Да, вы можете зашифровать все столбцы в всех таблицах для всей базы данных. Однако существуют ограничения по типам и ограниченная поддержка операций зашифрованных типов. Я советую использовать AE на очень чувствительных столбцах и в противном случае использовать TDE, который находится в состоянии покоя с шифрованием.