Я тоже начинаю с этих фреймворков, и это то, что я собираю.
Caliburn существует дольше и, на мой взгляд, выглядит более зрелым в некоторых отношениях. Например, он поддерживает несколько контейнеров IoC. Тем не менее, некоторые реализации общих функций, реализованные в Prism, тоже хороши, и основатель Caliburn даже удалил некоторые функции, которые вы затем получите от Prism.
Большим преимуществом Prism является то, что он официально принадлежит Microsoft и, вероятно, в некоторых отношениях станет зрелым стандартом. В будущем они также будут поддерживать другие IoC, кроме Unity.
Из моего прочтения представляется возможным фактически использовать оба, и именно это я изучаю. Я отправлю обратно, если у меня будет успех