Вы можете отключить рендеринг направляющих отступа с помощью:
"editor.renderIndentGuides": false,
или настройки цвета, используя:
"editorIndentGuide.activeBackground": "#fff8",
"editorIndentGuide.background": "#fff0",
Вторая настройка выше сделает прозрачные неактивные направляющие и первуюнастройка сделает текущее активное отступное руководство ярко-серым.