Столкнулся с аналогичной проблемой в Centos 7 и решил ее путем установки инструментов разработки.
Чтобы скомпилировать и установить нативные дополнения из npm, вам необходимо установить инструменты разработки.
Запуск следующегокоманды решат вашу проблему;
sudo apt install gcc g ++ make
npm install