Какая структура данных для многомерных данных МРТ (несколько методов, срезы, сегменты) в R? - PullRequest
0 голосов
/ 19 ноября 2018

Я все еще новичок в R и использую Excel для организации своих данных, и это очень грязно, поэтому я хочу поместить все в некоторую структуру данных в R, чтобы позже их визуализировать.

Мои данныесостоит из значений, полученных из алгоритма, который анализирует каждый пиксель изображений МРТ органа.Изображения получены с использованием двух разных методов (метод A и B), и орган изображается в 8 срезов, охватывающих весь орган.Каждое изображение органа разделено на 6 анатомических сегментов, и наш код MATLAB берет среднее значение и SD пикселей в каждом сегменте.

В конце анализа у меня есть 4 таблицы.Два для средних (по одному для каждого метода) и два для значений SD (по одному для каждого метода).Столбцы таблиц представляют сегменты (сегменты 1-6), а строки представляют собой фрагменты (фрагменты 1-8).Это для одного пациента, и мы сканируем несколько пациентов.

Я хочу организовать данные так, чтобы было легко создавать визуализации, чтобы я мог сравнивать различные методы для всех пациентов или смотреть на значения дляразличные срезы, или просто посмотрите на определенные сегменты.

Если я использую один фрейм данных, должно ли каждое наблюдение быть срезом?Или одно значение из одного среза и сегмента?Должен ли я использовать несколько фреймов данных?Я немного растерялся из-за того, как лучше всего это организовать, поскольку у меня не было предыдущего опыта работы с наборами данных.

Спасибо за вашу помощь, и, если требуется больше разъяснений, пожалуйста, дайте мне знать.

1 Ответ

0 голосов
/ 19 ноября 2018

Вы можете сгладить ряды.Таким образом, в основном у вас будет 48 (i.e. 6 x 8) столбцов и столько же строк, сколько число пациентов.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...