Получение графики высокого разрешения из пакета для публикации

Question

Я использую пакет "R" "ropls" (https://www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/manuals/ropls/man/ropls.pdf)

Я пытаюсь получить графику из пакета в высоком разрешении для публикации. Однако мне пока не повезло. Кажется, я не могу изменить графики, созданные пакетом.

Вот код:

    > source("http://bioconductor.org/biocLite.R")                            
    > biocLite("ropls")   #install ropls package
    > library(ropls)
    > data(sacurine)
    > attach(sacurine)
    > sacurine.oplsda <- opls(dataMatrix, sampleMetadata[, "gender"], predI = 1, orthoI = NA)
    > plot(sacurine.oplsda)
    > detach(sacurine)

Я хочу сохранить «сводный» сюжет, созданный в высоком разрешении. Я хочу получить сюжет в формате .tiff и .pdf в высоком разрешении.

Любая помощь очень ценится. Спасибо.

Answer 1

Попробуйте вывести сводный файл в PDF, используя следующую команду:

сюжет (sacurine.oplsda, typeVc = "summary", file.pdfC = "Graph")

Выходные графики представляют собой векторные PDF-файлы и, следовательно, могут быть преобразованы с помощью какой-либо другой программы из PDF-файла в файл TIFF с любым разрешением, которое вы хотите. Я не знаю, в какой операционной системе вы находитесь, но Preview на Mac сделает это за вас. Просто откройте PDF и экспортируйте как TIFF. Остерегайтесь размеров файлов, тем не менее, я конвертировал 8,2 кБ PDF в TIFF 1200 точек на дюйм (эй, вы хотели высокое разрешение!), И это было 282 МБ!