Вы можете разделить их на отдельные приложения, и они будут работать в контексте вашего проекта.
Вы также можете создать каждое приложение, чтобы оно было полностью независимым. Это часто требует немного больше работы, хорошим примером этого является Django-тегирование, которое вы можете в основном прикрепить к любому другому объекту.
Так что да, вы можете сделать это. Однако, если приложение только для вас, оно может не стоить усилий (ИМХО);)