Редактирование machine.config приведет к перезагрузке всех доменов приложений на сервере. По сути, это то же самое, что сброс IIS с точки зрения приложения ASP.Net. Хотя полный сброс IIS делает немного больше.
Обратите внимание, что редактирование файла web.config для приложения приведет к перезапуску только рабочего процесса этого домена приложения, а не всего сервера.