Я немного запутался в том, что вы на самом деле хотите, но я собираюсь пойти с вами, чтобы узнать DependencyInjection of Mapper.
В Startup.cs, в ConfigureServices вы можете добавить экземпляр Scoped
services.AddScoped<IMapper, Mapper>();
Это позволит вам внедрить Mapper в любой конструктор, что в основном позволяет вамиспользуйте его в качестве экземпляра службы в вашем приложении.