Похоже, вам просто нужно установить уровень регистрации для этого класса.Установите значение ERROR, WARN или другой уровень, в зависимости от уровня сообщений, которые заполняют консоль.Попробуйте изменить файл application.properties, добавив что-то вроде:
logging.level.com.test.MyClass=WARN