Применение функции к списку путей к файлам и запись вывода csv в соответствующие пути - PullRequest
0 голосов
/ 20 ноября 2018

Как применить функцию к списку созданных мной путей к файлам и записать вывод csv по тому же пути?

чтение файла в подпапке -> выполнить функцию -> записать файл в подпапку -> перейти в следующую подпапку

#opened xml by filename
with open(r'XML_opsReport 100001.xml', encoding = "utf8") as fd:
    Odict_parsedFromFilePath = xmltodict.parse(fd.read()) 

#func called in func below
def activity_to_df_one_day (list_activity_this_day): 
    ib_list = [pd.DataFrame(list_activity_this_day[i], columns=list_activity_this_day[i].keys()).drop("@uom") for i in range(len(list_activity_this_day))]
    return pd.concat(ib_list)

#Processes parsed xml and writes csv 
def activity_to_df_all_days (Odict_parsedFromFilePath, subdir): #writes csv from parsed xml after some processing
    nodes_reports = Odict_parsedFromFilePath['opsReports']['opsReport']
    list_activity = []
    for i in range(len(nodes_reports)):
        try:
            df = activity_to_df_one_day(nodes_reports[i]['activity'])
            list_activity.append(df)

        except KeyError:
            continue
    opsReport = pd.concat(list_activity)
    opsReport['dTimStart'] = pd.to_datetime(opsReport['dTimStart'], infer_datetime_format =True)
    opsReport.sort_values('dTimStart', axis=0, ascending=True, inplace=True, kind='quicksort', na_position='last')
    opsReport.to_csv("subdir\opsReport.csv") #write to the subdir




def scanfolder(): #fetches list of file-paths with desired starting name.

    list_files = []

    for path, dirs, files in os.walk(r'C:\..\xml_objects'): #directory containing several subfolders
        for f in files:
            if f.startswith('XML_opsReport'):
                list_files.append(os.path.join(path, f))
    return list_files

filepaths = scanfolder() #list of file-paths  

Каждая функция работает хорошо,Обработка XML хороша, поэтому я не разделяю структуру XML.В filepaths есть более 100 путей, каждый из которых представляет собой отдельный подкаталог.Я хочу иметь возможность применять вышеуказанный поток и в будущем, где я могу получить пути к файлам и выполнять желаемые действия.Важно записать файл csv в его подкаталог.

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 22 ноября 2018

удалось решить с помощью os.path.join.

    exceptions_path_list =[]
    for i in filepaths:
        try:
            with open(i, encoding = "utf8") as fd:
                doc = xmltodict.parse(fd.read())
                activity_to_df_all_days (doc, i)
        except ValueError:
            exceptions_path_list.append(os.path.dirname(i))
            continue

    def activity_to_df_all_days (Odict_parsedFromFilePath, filepath):
        ...
        ...
        ...    
        opsReport.to_csv(os.path.join(os.path.dirname(filepath), "opsReport.csv"))
0 голосов
/ 20 ноября 2018

Чтобы получить каталог, в котором находится файл, вы можете использовать:

import os

for root, dirs, files, in os.walk(some_dir):
    for f in files:
        print(root)
        output_file = os.path.join(root, "output_file.csv")
        print(output_file)

Это то, что вы ищете?

Вывод:

somedir
somedir\output_file.csv

См. Также Python 3 - дерево каталогов путешествий с ограниченной глубиной рекурсии и Найти текущий каталог и каталог файла .

...