Я не могу воспроизвести это на Linux.Тем не менее, в качестве обходного пути, не требующего больших усилий, вы можете сделать что-то вроде этого:
const {app, BrowserWindow} = require('electron');
BrowserWindow.prototype.my_hide = function() {
this.blur();
this.hide();
return;
};
let window = null;
window = new BrowserWindow({...init...});
//at a point where you want to blur and hide your window
window.my_hide();