Для конкретного случая Cd вы можете использовать Cc Cd , который связан с eshell-send-eof-to-process
.В противном случае используйте Cq для кавычки-вставки, чтобы принудительно вставить следующий символ в буфер, даже если он имеет привязку ключа в Emacs.