Попытка отредактировать имя файлов, которые будут использоваться в качестве ввода в скриптах bash - PullRequest
0 голосов
/ 29 января 2019

Я пробую несколько файлов, которые выглядят так:

k27.contigs.fa;где значение (например, 27) отличается

Я пытаюсь написать цикл for для функции для каждого из моих файлов, и функции выглядят так:

megahit_toolkit contig2fastg 99 k99.contigs.fa > k99.fastg

for x in *.contigs.fa
do 
   megahit_toolkit contig2fastg ${x%.contings.fa*} $x > ${x%.contings.fa*}.fastg
done

Как изменитькод, чтобы я мог заменить число и игнорировать k до этого?

...