Наиболее вероятным объяснением является то, что ваш текущий каталог не там, где вы думаете, что он есть. Вы можете проверить системное свойство user.dir, чтобы увидеть, каков базовый путь приложения, или вы можете сделать что-то вроде этого:
System.out.println(new File(".").getCanonicalPath());
прямо перед тем, как использовать относительный путь для отладки, с которого начинается ваша относительная ссылка.