rrallel :: makeCluster () висит на Mac - PullRequest
       1

rrallel :: makeCluster () висит на Mac

0 голосов
/ 20 сентября 2018

Это несколько похоже на то, что было задано здесь , но не решено.

Я делаю первые шаги в использовании нескольких ядер для моих программ на R, используя пакет parallel,(К сведению, приложение является оценщиком максимального правдоподобия и некоторыми стандартными ошибками при загрузке.)

Когда я запускаю следующее, чтобы включить кластер с использованием двух ядер

cl <- parallel::makeCluster(2)

Rпросто висит бесконечно.

Следуя приведенному выше вопросу, я пытаюсь понять, что может пойти не так, запустив

cl <- future::makeClusterPSOCK(1, outfile = NULL, verbose = TRUE)

, что дает:

Workers: [n = 1] ‘localhost’
Base port: 11662
Creating node 1 of 1 ...
- setting up node
Starting worker #1 on ‘localhost’: '/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/Rscript' --default-packages=datasets,utils,grDevices,graphics,stats,methods -e 'parallel:::.slaveRSOCK()' MASTER=localhost PORT=11662 OUT= TIMEOUT=2592000 XDR=TRUE
Waiting for worker #1 on ‘localhost’ to connect back
starting worker pid=89528 on localhost:11662 at 09:36:27.211
Error in socketConnection(master, port = port, blocking = TRUE, open = "a+b",  : 
  cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... doTryCatch -> recvData -> makeSOCKmaster -> socketConnection
In addition: Warning messages:
1: In as.POSIXlt.POSIXct(x, tz) :
  unknown timezone 'zone/tz/2018e.1.0/zoneinfo/Europe/London'
2: In socketConnection(master, port = port, blocking = TRUE, open = "a+b",  :
  localhost:11662 cannot be opened
Execution halted
Error in socketConnection("localhost", port = port, server = TRUE, blocking = TRUE,  : 
  reached elapsed time limit

Я попытался перезапустить R, RStudio, мой ноутбук, очистить рабочее пространство и т. Д., Но безрезультатно.Кто-нибудь знает, что может происходить?

Спасибо за вашу помощь!

Sessioninfo:

R version 3.4.1 (2017-06-30)
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
Running under: macOS High Sierra 10.13.6

Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_GB.UTF-8/en_GB.UTF-8/en_GB.UTF-8/C/en_GB.UTF-8/en_GB.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] compiler_3.4.1      parallel_3.4.1      tools_3.4.1         listenv_0.7.0       yaml_2.2.0         
 [6] optimParallel_0.7-3 codetools_0.2-15    gdata_2.18.0        matrixcalc_1.0-3    digest_0.6.15      
[11] Formula_1.2-3       globals_0.12.3      gtools_3.5.0        future_1.9.0  

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 15 октября 2018

Для тех, кто мог столкнуться с той же проблемой, в итоге работало добавление 192.0.0.1 localhost в мой /etc/hosts файл

0 голосов
/ 12 октября 2018

У меня была такая же проблема.Изменение разрешения в рабочем каталоге (рекурсивно) решило это с помощью chmod -R u+rwx решило это.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...