В основном, во время ваших различных правок вы удалили исходное сообщение об ошибке, которое было в первом сообщении:
SRVE0164E: Web Application MyApp_war#Tomcat Host Manager springboot.Application uses the context root /*, which is already in use by Web Application DefaultApplication#Default Web Application. Web Application Tomcat Host Manager springboot.Application will not be loaded.
, которое объясняет все:
Вы не можете иметь 2 приложения, сопоставленные с /
context, так что либо измените контекст для установленного DefaultApplication, либо для вашего приложения.