Переставьте код следующим образом:
os.chdir("C:\\Users\\user\\Desktop\\" +FolderName)
i=1
while i < 10:
doc = Document()
doc.add_paragraph('Title/Keyword:'+str(titles[i]));
doc.add_paragraph('Research Link:'+str(link[i]));
doc.add_paragraph('Target Site:'+str(keyword[i]));
doc.save(str(doc_number[i])+str(essay_type[i])+' '+str(titles[i])+' '+str(writer[i])+'.docx');
i+=2