Нет, это не поддерживается.Spring MVC и Spring WebFlux имеют разные модели времени выполнения и не поддерживают одни и те же серверы (например, Spring WebFlux может работать с Netty, Spring MVC не может).
Кроме того, Spring MVC и Spring WebFlux являются полноценной сетьюфреймворки, то есть каждая из них имеет свою собственную инфраструктуру, которая так или иначе дублирует другую.Развертывание обоих в одном приложении затруднит сопоставление запросов (какие запросы должны идти куда?).