Вы можете использовать метод MapPath
.Если вы используете его в файле ode-behind для веб-страницы:
string path = Server.MapPath("/mysite/myvirtualfolder/somefile.txt");
Если вы используете его в классе, которого нет в файле code-behind:
string path = HttpContext.Current.Server.MapPath("/mysite/myvirtualfolder/somefile.txt");