С двумя сайтами и, возможно, несколькими библиотеками документов, возможно, подойдет ручная миграция: вручную создайте сайты / библиотеки назначения и синхронизируйте их для заданной библиотеки.Поскольку это новая библиотека, контент для синхронизации отсутствует, но он будет создавать папки и т. Д. На локальном компьютере с помощью onedrive.Откройте это место с помощью проводника Windows.Затем перейдите в исходную библиотеку с помощью Internet Explorer и используйте команду open with windows explorer.(или синхронизировать это также).Затем просто скопируйте файлы из исходной в целевую библиотеку в представлении Windows Explorer onedrive.OneDrive позаботится о синхронизации файлов до библиотеки.
Если у вас есть несколько библиотек или если вам нужно сохранить такие вещи, как даты создания файлов, тогда полезны сторонние инструменты.Еще один популярный - ShareGate.