Как вы уже читали, таблицы InnoDB всегда используют PRIMARY KEY или первый не-NULL UNIQUE KEY в качестве своего кластеризованного индекса.
Если таблица не имеет ни одного из них, она генерирует свой собственный кластеризованный индекс, иназывает это «GEN_CLUST_INDEX».
mysql> create table test.testy ( i int ); -- no eligible clustered index
mysql> select t.name as table_name, i.name as index_name
from information_schema.innodb_sys_tables t
join information_schema.innodb_sys_indexes i using (table_id)
where i.name = 'GEN_CLUST_INDEX';
+------------+-----------------+
| table_name | index_name |
+------------+-----------------+
| test/testy | GEN_CLUST_INDEX |
+------------+-----------------+