Вы можете открыть новое окно и вставить туда контейнер с диаграммой, например, таким образом:
document.getElementById('btn').addEventListener('click', function() {
var chartWindow = window.open("", "_blank", "left=0,top=0,width=600,height=450"),
chartContainer = document.createElement("div");
chartContainer.setAttribute("id", "container");
Highcharts.chart(chartContainer, {
series: [{
data: [1, 2, 3]
}]
});
chartWindow.document.body.appendChild(chartContainer);
});
Демонстрационная версия: http://jsfiddle.net/BlackLabel/a235bh1z/