Циклически перебирайте массивы, как вы делаете, и увеличивайте счетчик секунд, когда фрукт соответствует одному из операторов case.Используйте счетчик, чтобы получить номер года из массива:
var fruits, text, year, i;
fruits = ["Banana", "Orange", "Apple", "Mango"];
year = ["0", "1", "2", "3"];
text = "<ul>";
let counter = 0; // <-- define a second counter
for (i = 0; i < fruits.length; i++) {
switch (fruits[i]) {
case 'Mango':
text += "<li>" + fruits[i] + "</li>";
text += "<li><b>" + year[counter] + "</b></li>";
counter++; // <-- that only get's incremented when a case is matched
break;
case 'Pine apple':
text += "<li>" + fruits[i] + "</li>";
text += "<li><b>" + year[counter] + "</b></li>";
counter++;
break;
case 'Grape':
text += "<li>" + fruits[i] + "</li>";
text += "<li><b>" + year[counter] + "</b></li>";
counter++;
break;
case 'Banana':
text += "<li>" + fruits[i] + "</li>";
text += "<li><b>" + year[counter] + "</b></li>";
counter++;
break;
}
}
text += "</ul>";
document.getElementById("demo").innerHTML = text;
<p id="demo"></p>