список dge с ошибкой подсчета NA для значений идентификатора стенограммы - PullRequest
0 голосов
/ 31 января 2019

Я новичок в R и анализирую данные RNA seq.Это формат моего фрейма данных

transcript_id C1 C2 C3 B4 B5 B6 E4 E5 E6 
ENSG00000000003 2019 1619 1597 1343 1026 1010 871 1164 1115 
ENSG00000000005 1 2 1 1 1 2 0 0 0 
ENSG00000000419 1936 1469 1769 2604 2244 2132 2301 2332 2184 
ENSG00000000457 790 826 858 693 561 489 456 615 533 
ENSG00000000460 320 372 362 368 285 282 254 342 265

Когда я использую команду

data <- DGEList(counts) 

Я получаю ошибку

Ошибка: подсчет NA не разрешен,

Я понимаю, что это из-за столбца transcript_id, потому что когда я его удаляю, он работает нормально.Какие-либо предложения?Спасибо

data <- DGEList(counts)
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...