Вот несколько возможных исправлений:
1) Удалите текущую версию вашего приложения с симулятора и / или устройства. Это особенно необходимо при использовании Default.png или значков приложений. Существует множество ярлыков, которые компилятор использует для уже установленных приложений.
2) Убедитесь, что НИКОГДА нет папок сборки или пользовательских файлов (я думаю, pbuser.USERNAME). Эти файлы разрушили несколько проектов, и нам пришлось удалить их и начать заново.
3) Убедитесь, что все файлы svn добавляются в проект перед каждым коммитом (хотя это не имеет значения для вашей текущей проблемы.
4) Найдите измененный код и установите точки останова для отладчика, чтобы поймать. Я полагаю, что точки останова, которые становятся ЖЕЛТЫМИ во время работы, означают, что между прогоном и кодом есть разница.
Я склонен полагать, что это будет проблемой и для файла .proj, но, похоже, это не так.