Проверяете ли вы утечку памяти в приложении, поскольку это не имеет ничего общего с экземпляром EC2.Как вы упомянули, после перезагрузки все работало нормально.
Не рекомендуется использовать встроенный сервер в рабочей среде.
Я бы посоветовал вам использовать сервис AWS Elastic Beanstalk для развертывания приложения с весенней загрузкой, без дополнительной оплаты.