После многих испытаний я думаю, что решил проблему.Я выложу ответ, если у кого-то возникнут такие же проблемы.Как упомянуто здесь: https://stackoverflow.com/a/39759581/9834571 Вы можете добавить альтернативную команду python.Для меня это сработало, когда я изменил упомянутый пример следующим образом:
sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python ~/anaconda3/envs/ 2
update-alternatives --display python
cd /usr/local/MATLAB/R2018a/extern/engines/python/
python setup.py build --build-base=$(mktemp -d) install