Как мне убедиться, что исполняемые файлы Graphviz находятся в PATH моей системы? - PullRequest
Новая
       20

Как мне убедиться, что исполняемые файлы Graphviz находятся в PATH моей системы?

0 голосов
/ 24 сентября 2018

Я работаю с Graphviz, используя Python 3 на Sublime Text 3. Когда я запускаю этот код: 

data = tree.export_graphviz(dtGini[55], out_file = None)
graph = graphviz.Source(data)
graph.render("testingthis")

Я получаю следующие ошибки: 

FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

graphviz.backend.ExecutableNotFound: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'testingthis'], make sure the Graphviz executables are on your systems' PATH

Похоже, что можетне могу найти нужные файлыВ Sublime Text 3 мои пользовательские настройки для Conda: 

{
// executable is the path to anaconda's python
// this python executable is used in order to find conda
"executable": "C:/ProgramData/Miniconda3/python.exe",

// Directory in which the conda envs are stored
// Default location is the user's home directory
"environment_directory": "C:/ProgramData/Miniconda3/envs",

// configuration is the path to conda's configuration file
"configuration": "~/.condarc"
}

У меня есть следующие переменные окружения из моей панели управления: 

C:\ProgramData\Miniconda3\Scripts\
C:\ProgramData\Miniconda3\
C:\ProgramData\Miniconda3\conda-meta\history
C:\Users\X\AppData\Local\conda\conda\pkgs
C:\Users\X\AppData\Local\conda\conda\pkgs\graphviz-2.38-hfd603c8_2\Library\bin
C:\Users\X\AppData\Local\conda\conda\pkgs\graphviz-2.38-hfd603c8_2\Library\bin\dot.exe

В приглашении Anaconda, когда я вхожу в Python,нажмите ввод, а затем введите «импортировать графвиз», я не получаю ошибку.В Sublime Text 3, если у меня просто есть файл наподобие graph.py 

import graphviz

Он выполняется без ошибок.

Есть идеи, как мне это решить?Это сводит меня с ума.Спасибо!

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 28 сентября 2018

Решением для меня было загрузить Graphviz с их сайта (хотя я уже скачал его из CMD), а затем изменить переменную PATH, чтобы отразить местоположение установки.

0 голосов
/ 27 сентября 2018

Я следовал решению, опубликованному @ aprameyo roy здесь> «RuntimeError: Убедитесь, что исполняемые файлы Graphviz находятся в пути вашей системы» после установки Graphviz 2.38

Необходимый системный путь занял определенное место на моем ПК - я использовал Ananconda для установки пакета graphviz.

Добавление этих двух команд в мою записную книжку jupyter решило проблему - измените адрес C: / на место установки:

(PS. Я думаю, вам нужно будет повторять это после каждогокернал рестарт.) 

# extra step to allow graphviz to be found 
import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Users/jed/Anaconda3/envs/keras/Library/bin/graphviz/'
...