Вы инициализировали репозиторий Git ... в (голом) репозитории git year_1.git!
В голом репо должен быть любой файл, кроме внутренних файлов Git.
Когда вы нажимаете, выфактически подталкивает родительский репозиторий Git, который не изменился.Следовательно, все обновлено.
Вместо этого вы должны клонировать http://52.76.185.100:3000/ubuntu/year_1.git
репо в другом месте и добавлять туда файлы, а не работать в самой папке репо.
cd /a/apth
git clone http://52.76.185.100:3000/ubuntu/year_1.git
cd year_1
# add files
# git add; git commit; git push