Попробуйте напечатать, и вы увидите:
import csv
reader1 = csv.reader(open('interactors.csv', 'r'), delimiter=" ")
row1 = next(reader1)
print(row1)
reader2 = csv.reader(open('proteome_plas.csv', 'r'), delimiter=" ")
row2 = next(reader2)
print(row2)
Вывод будет:
['col1', 'col2'] - row1
['col_11'] - row2
Вы пытаетесь получить доступ к элементу row2 [1], которого не существует
Попробуйте это:
import csv
reader1 = csv.reader(open('interactors.csv', 'r'), delimiter=" ")
row1 = next(reader1)
print(row1)
reader2 = csv.reader(open('proteome_plas.csv', 'r'), delimiter=" ")
row2 = next(reader2)
print(row2)
# Maybe in your case need to fill row2 to len(row1)
if row1 == row2:
print ("match")
else:
print ("different")
И если вы хотите получить любой равный элемент: используйте
max_row = row1 if len(row1) > len(row2) else row2
min_row = row2 if len(row1) > len(row2) else row1
for elem in min_row:
if elem in max_row:
print('match')
break