Краткий ответ на ваш вопрос: когда вы устанавливаете пакеты из исходного кода, вы должны использовать установщик пакетов setup.py, чтобы установить их автоматически и правильно. Этот установщик уже знает, где правильно установить модули, чтобы Python мог их найти. Чтобы использовать, просто позвоните с точным интерпретатором Python, с которым вы хотите использовать пакет.
Ускоренный курс в setup.py. Сначала запустите его с точным исполняемым файлом Python, для которого вы хотите, чтобы пакет был доступен. Если вы хотите использовать пакет с /usr/bin/python2.5, вы должны использовать /usr/bin/python2.5 для запуска setup.py. Во-вторых, перейдите в каталог, где установлен пакет setup.py. В-третьих, вы должны установить как root, так что проще всего сделать как root. В-четвертых, если вы хотите установить несколько интерпретаторов Python, вы должны запустить setup.py с каждым, но вы должны очистить его между ними. Итак, вот что я бы сделал:
% cd /root/directory/of/untarred/source/package
% sudo su
# /path/to/first/python setup.py build install
# rm -rf build
# /path/to/second/python setup.py build install
# rm -rf build
# exit
%
Если вы устанавливаете модули вручную ... вы не должны, вы должны использовать setup.py. (Если вы написали новый модуль, вы должны написать для него setup.py.) Если вы должны установить вручную, вам необходимо выяснить, какой каталог следует установить для каждого Python. либо путем исследования и эксперимента, либо путем вызова тех же библиотек, которые вызывает установщик, чтобы определить правильный каталог. Установщики, использующие distutils, звонят distutils.sysconfig.get_python_lib(); установщики, использующие setup_tools, ищут в setup_tools.command.easy_install.easy_install.INSTALL_SCHEMES[os.name]["install_dir"].
Относительно dist-packages: У меня был разговор с сопровождающим пакета Python для Debian в начале этого года. Он реализовал это dist-packages в бета-пакетах, собранных в Ubuntu 9.04, но в коде была ошибка PYTHONUSERBASE, которую я опрокинул. Мы немного поговорили. IIRC причина, по которой dist-packages была как-то связана с принуждением пользователя устанавливать пакеты в другой каталог, отличающийся от apt-get . Я, правда, не совсем понимаю мотивацию, потому что на практике и пользователь, и apt-get все еще устанавливаются в один и тот же каталог.
lib-dynload не вещь Debian; это каталог, который сам Python устанавливает. Я считаю, что это был каталог только для разделяемых библиотек, реализующих модули. Я не уверен, что Python все еще использует его.
Наконец, я не знаю, что вы подразумеваете под "только python2.6 на самом деле работает". А как насчет этих каталогов с разными именами "не работает"?