Согласно моим тестам, нет никакой разницы между этими двумя подходами с точки зрения навигации - оба создают запись истории (поэтому GoBack работает правильно), оба поддерживают URI HTTP / HTTPS, а также локальные файлы, использующиеms-appdata: и ms-appx: протоколы.
Единственное различие, о котором я могу подумать, заключается в том, что Source позволяет вам считывать текущий отображаемый URI (в дополнение к его настройке) и поддерживает данные-привязка, так что вы можете использовать его в манере MVVM.